Reproduzierbare Simulationsexperimente für COVID-19 via BioModels und B2SHARE

Die Modellierung und Simulation gewinnt für die Versuchsplanung und Ergebnisanalyse in der Biomedizin rasch an Bedeutung. Wie vor kurzem beim Ausbruch der COVID-19-Pandemie beobachtet wurde, bieten Modelle rationale Vorhersagen für das Verhalten epidemiologischer Systeme für potenzielle Interventionen wie antivirale Therapien und als Werkzeuge für die Ausbildung und Informationsverbreitung.

Das letztendliche Ziel dieses Projekts ist die schnelle Verbreitung von Simulationsstudien von COVID-19-Modellen in interoperablen Formaten und in hoher Qualit?t an die Forschungsgemeinschaft. Greifswald wird aktiv auf Modellierer zugehen und Unterstützung anbieten, um den Modellcode COMBINE-konform zu machen. BioModels wird zus?tzliche Kurationsdienste anbieten, die sich auf COVID-19-bezogene Studien konzentrieren, und Modelle mit zus?tzlichen Ressourcen verknüpfen; auf diese Weise werden die Modelle besser zug?nglich, so dass Epidemiologen die Anwendbarkeit auf COVID-19 und auf andere potenzielle Krankheitsausbrüche weiter beurteilen k?nnen. Ein Softwareentwickler wird schnelle Aktualisierungen der COMBINE-Bibliotheken unterstützen, und ein erfahrener Modellierer wird beim Polieren des Modellcodes helfen.

Mit der von EOSC erhaltenen Finanzierung werden wir einen neuartigen Arbeitsablauf für die Schnellkuration von Daten einrichten. Wir sind davon überzeugt, dass dies den Einsatz von Simulationsmodellen zur Vorhersage des Krankheitsverlaufs und der Krankheitsursache f?rdern und damit zur Identifizierung von Therapiezielen sowie zur Festlegung des Weges zu neuen Analysewerkzeugen und Bildungsressourcen beitragen wird.