SFB 1404/2: Energie-Optimierung von Workflows in der Bioinformatik (TP A02)

In vielen bioinformatischen Anwendungen k?nnen DAWs durch eine Optimierung des Workflows verbessert werden, wie zum Beispiel durch die verteilte Ausführung von einfach parallelisierbaren Problemen. In der ersten Phase von FONDA haben wir Methoden entwickelt, die einen für eine Infrastruktur A entwickelten Workflow automatisch so umzuschreiben, dass er auch effizient auf einer Infrastruktur B ausgeführt werden kann. Dieses Umschreiben basiert auf den Charakteristika des DAW und denen der Infrastruktur und berücksichtigt auch die Gr??e der zu analysierenden Daten. In Phase II wird das Teilprojekt ein anderes Optimierungsziel adressieren: die Verbesserung der Nachhaltigkeit von Workflowausführungen eine Senkung ihres Energie-verbrauchs. Dazu werden wir Verfahren und Algorithmen entwickeln, die den Energieverbrauch von Programmen und Workflows pr?zise sch?tzen und darauf basierend eine gleichwertige, aber energieeffizientere Variante erzeugen k?nnen, die au?erdem die pers?nlichen Pr?ferenzen der Benutzer*in berücksichtigt.